真空冷凍干燥機作為一個整體包括兩部分：冷凍干燥室和冷阱。它是一個獨立的上部和下部結構。冷凍干燥室大多采用透明有機玻璃蓋，便于觀察物料的冷凍干燥情況。這種凍干機在物料預凍后轉入干燥過程時需要手動操作。目前，真空冷凍干燥技術廣泛應用于生物工程、醫藥工業、食品工業、材料科學和農副產品深加工等領域。
水有三相：固態、液態和氣態。根據熱力學中的相平衡理論，水的冰點隨壓力的降低變化不大，但沸點卻越來越低，接近冰點。當壓力下降到一定的真空度時，水的沸點和冰點重合，冰可以直接蒸發成氣體而不需要液體。這個過程叫做升華。食品真空冷凍干燥是在水三相點以下，即低溫低壓條件下，將食品中的冷凍水升華并除去。
真空冷凍干燥機的正確使用方法如下：
1、將待凍干的樣品在冰箱中冷凍，事先用密封膜或保鮮膜密封瓶口，并將小孔扎緊。
2、啟動前檢查（電源、真空泵等）
（1） 將真空泵放在地面上，與主機保持一定的高度差。防止因突然斷電而導致回油。停電時，應立即旋松充氣閥進行充氣，并盡快取出樣品。
（2） 真空泵油應定期更換，并注意保養。通過玻璃窗觀察油量，好控制在2/3左右，太多容易噴油，太少容易真空不足。
3、打開主電源開關，按下“制冷”鍵。儀器使用前需要冷卻半小時。
4、從冰箱中取出待凍干樣品，放置到位，緊固有機玻璃蓋，檢查○" 這個戒指密封得很好。然后將不銹鋼板壓在充氣閥上，拔出小管密封儀器。
5、按“真空表”鍵顯示真空度；再次按下“真空泵”鍵，真空泵將工作。
6、冷凍干燥后，先擰下充氣閥進行充氣，使空氣緩慢進入，然后關閉真空泵，防止真空泵回油。然后關閉真空計、制冷按鈕和主電源。后取下有機玻璃蓋，取出樣品保存。
7、之后，應清除真空冷凍干燥機冷井中的冰，以便下次使用。
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